Медорганизация и НДС: платить или не платить?

С 2026 года организации, которые применяют упрощенную систему налогообложения, становятся плательщиками налога на добавленную стоимость. Это нововведение коснется и медицинских центров, работающих на УСН. Однако в медицинской сфере не всё так страшно, как может показаться на первый взгляд, потому что законодательство традиционно освобождает медицинские услуги от этого налога.

НДС платить или не платить?

Главный принцип здесь простой: если у организации есть лицензия на медицинскую деятельность, и она оказывает населению услуги по диагностике, профилактике и лечению, то НДС платить не нужно. Это прямо сказано в Налоговом кодексе, а именно в подпункте 2 пункта 2 статьи 149. Казалось бы, всё ясно, но на практике возникает множество вопросов.

Дело в том, что перечень таких льготных услуг утвержден правительством еще в 2001 году  (Перечень медицинских услуг по диагностике, профилактике и лечению, оказываемых населению, реализация которых независимо от формы и источника их оплаты не подлежит обложению НДС, утвержден постановлением Правительства РФ от 20.02.2001 N 132 (далее — Перечень), и он сформулирован очень общо. Например, там указаны просто «услуги скорой медицинской помощи» или «услуги, оказываемые населению амбулаторно».

Поэтому чиновники и суды давно выработали подход, как понять, попадает ли конкретная платная услуга вашей клиники под освобождение от налога. Ориентироваться нужно на три документа, которые регулируют медицинскую деятельность как таковую. Это вышеупомянутый Перечень, Положение о лицензировании медицинской деятельности, утвержденное Постановлением Правительства № 852 от 01.06.2021 г., Классификатор работ и услуг, составляющих медицинскую деятельность, который утвержден приказом Минздрава № 866н от 19.08.2021 г.

Если услуга, которую вы оказываете, упомянута в этих документах, значит, с точки зрения государства это полноценная медицинская услуга, и она освобождается от НДС. На это не раз указывал Минфин в своих разъяснениях, например, в письмах от 01.08.2025 N 03-07-07/74698, от 30.09.2024 N 03-07-07/94190, от 04.12.2023 N 03-07-07/116594 .

Название услуги в прайсе может стоить вам денег

Но здесь есть один тонкий момент, который касается каждого медицинского центра, оказывающего платные услуги. Дело в том, что многие клиники в своих прайс-листах используют удобные для пациента формулировки, которые могут не совпадать с официальными названиями. К примеру, услуга «Консультация врача по результатам анализов» звучит вполне обычно и понятно для пациента. Однако в официальной Номенклатуре медицинских услуг, утвержденной Минздравом приказом № 804н, такой формулировки может и не быть. Там, скорее всего, будет значиться «Прием (осмотр, консультация) врача-специалиста повторный». Сама по себе услуга, конечно, медицинская, но вот её название в прейскуранте расходится с официальным.

И тут возникает вопрос: заставит ли налоговая платить НДС из-за такой формулировки? Сама по себе Номенклатура медицинских услуг, утвержденная приказом № 804н, не является документом, напрямую определяющим налоговые льготы. Она скорее нужна для стандартизации в самой медицине. Однако на практике, если налоговая инспекция будет проверять обоснованность освобождения от НДС, она обязательно посмотрит, есть ли ваша услуга в лицензии и в классификаторе Минздрава. Если, например, в классификаторе есть «повторный прием», а вы в чеке пробиваете «консультацию по анализам» и при этом не можете доказать, что это одно и то же, могут возникнуть споры. Риск заключается в другом: если ваша услуга окажется вовсе не поименована ни в одном из перечисленных документов, либо если она не направлена на диагностику, профилактику или лечение, а является, например, косметической или чисто сервисной, то освобождения от налога не будет. Такие услуги с 2026 года придется облагать НДС в общем порядке.

Особый случай: косметика и «спорные» услуги. Что делать уже сейчас?

Особое внимание следует уделить услугам, исключенным из льготного режима налогообложения. В соответствии с подпунктом 2 пункта 2 статьи 149 Налогового кодекса Российской Федерации, косметические услуги не подлежат освобождению от НДС, даже если они оказываются в лицензированной медицинской организации врачами-специалистами. Разграничение медицинских и косметических услуг должно производиться на основании цели оказания вмешательства: наличие лечебной, диагностической или профилактической направленности является определяющим фактором для применения льготы. В спорных ситуациях, когда услуга имеет комплексный характер или авторское наименование, не идентичное формулировкам в нормативных актах, налоговые органы могут трактовать сомнения в пользу бюджета. В связи с этим судебная практика, включая постановления арбитражных судов округов, указывает на необходимость доказательства медицинской направленности услуги.

Поэтому самое разумное, что можно сделать уже сейчас, — это сверить свой прейскурант с действующим классификатором медицинских услуг и с положением о лицензировании. Важно убедиться, что каждая позиция, которую вы считаете медицинской и не хотите облагать налогом, четко прописана в этих документах. Названия в прайсе лучше привести в соответствие с официальными или как минимум иметь внутреннее обоснование, что конкретная услуга соответствует определенному пункту классификатора. Это позволит спокойно пользоваться льготой и не начислять налог, сохраняя цены для пациентов прежними. Если же какие-то услуги выходят за рамки утвержденного перечня, к ним действительно нужно готовиться применять НДС с 2026 года.